O Departamento de Farmacologia é constituído pelos seguintes Laboratórios :
Laboratório de Biologia Vascular
Laboratório de Farmacologia Cardiovascular
Laboratório de Farmacologia da Inflamação e da Dor
Laboratório de Farmacologia da Analgesia e Dor
Laboratório de Farmacologia Cardiovascular e da Inflamação – LAFACI
Laboratório de Farmacologia Vascular
Laboratório de Neurofarmacologia
Laboratório de Neuropsicofarmacologia
Laboratório de Substâncias Antitumorais
Laboratório de Farmacologia da Junção Neuromuscular e Toxinologia